Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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