Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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