Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM2Q13029 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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