Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX10Q12887 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX10Q12887 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX10Q12887 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms