Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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