Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN1Q12860 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN1Q12860 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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