Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BPTFQ12830 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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