Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms