Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
POLEQ07864 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms