Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN1BQ07699 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN1BQ07699 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN1BQ07699 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN1BQ07699 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN1BQ07699 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SCN1BQ07699 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SCN1BQ07699 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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