Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms