Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms