Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC6Q03468 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms