Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OC90Q02509 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OC90Q02509 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms