Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRG1Q02297 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms