Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms