Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHDQ02161 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms