Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAP1Q01518 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms