Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB15P59190 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms