Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC26A5P58743 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms