Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP3P54852 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP3P54852 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms