Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKAA2P54646 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms