Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCL1P53675 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCL1P53675 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms