Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSCP53634 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSCP53634 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSCP53634 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.6 ms