Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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