Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AC100803.1-201ENST00000501440 1380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP1P53384 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms