Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB9AP51151 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms