Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RAB5CP51148 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5CP51148 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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