Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms