Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX1P48742 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHX1P48742 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHX1P48742 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX1P48742 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX1P48742 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX1P48742 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX1P48742 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LHX1P48742 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms