Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms