Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms