Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms