Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms