Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC13P31276 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms