Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms