Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms