Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PVALBP20472 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PVALBP20472 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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