Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME1P15531 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME1P15531 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME1P15531 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms