Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms