Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTN1P12814 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms