Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMDP11532 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMDP11532 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DMDP11532 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DMDP11532 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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