Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHGAP10645 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms