Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI3P10071 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI3P10071 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms