Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHEP01854 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms