Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms