Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATE1O95260 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATE1O95260 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATE1O95260 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATE1O95260 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATE1O95260 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATE1O95260 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATE1O95260 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATE1O95260 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATE1O95260 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATE1O95260 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATE1O95260 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATE1O95260 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms