Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAG9O60271 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
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