Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DHHO43323 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DHHO43323 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DHHO43323 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms