Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVH48-1M5A8F1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVH48-1M5A8F1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms